Virus klíšťovky
Virus klíšťovky patří do rodu flavivirů. V tomto rodě se s sním nacházejí také viry žluté zimnice, japonské encefalitidy a horečky dengue. Zároveň většina flavivirů patří mezi arboviry.
Označení „arbovirus“ se používá pro viry přenášené specifickým způsobem – pomocí klíšťat a komárů. Samotné slovo „arbovirus“ vzniklo jako zkratka z anglických slov „arthropod-borne-viruses“, což znamená „viry přenášené členovci“.
Flaviviry jsou RNA viry obalené lipidovým obalem, které obsahují pouze tři různé strukturální proteiny. Protein C, M a E. Protein C vytváří kapsidu (anglicky capside), „krabičku“, ve které je uzavřena virová RNA. Proteiny M a E vytvářejí membránu, do které je celý virus zabalen. Obzvláště protein E vytváří povrch virové částice a je zodpovědný za tvorbu protilátek a indukci imunitních reakcí v infikovaném organismu.
Na celém světě
Antigenní analýzy provedené po celé evropské endemické oblasti ukázaly, že virus klíšťové encefalitidy je v celé své oblasti výskytu téměř stejný a ani nemění svou strukturu pod vlivem měnících se přírodních podmínek.
Viry klíšťové encefalitidy izolované v asijské části Ruska, severního Japonska a Číny jsou blízce příbuzné našemu evropskému podtypu. Liší se pouze svým přenašečem – druhem klíštěte, které tyto nebezpečné navštěvníky dopravuje ke svým hostitelům. Zatímco v Evropě je to především klíště Ixodes ricinus, na dalekém východě mají lidé tu čest s Ixodes persulcatus.